بررسی میزان کارآیی روش Real-Time PCR با استفاده از دو راهکار رسم منحنی استاندارد و رگرسیون خطی
نویسندگان
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: آنالیز کمّیmRNA با استفاده از Real-Time PCR بهوسیله روش سایبرگرین بهطور وسیعی در مطالعات بیولوژیک کاربرد بسیاری پیدا کرده است. هدف این تحقیق مقایسة کارآییPCR محاسبه شده با استفاده از دو روش شیب خط نمودار استاندارد و نرمافزارLinRegPCR جهت تعیین استراتژی بهتر برای محاسبة کارآیی PCR میباشد. روش بررسی: در این پژوهش پس از خونگیری و استخراج RNA و سنتز cDNAفرآیند qRT-PCR انجام شد.سپس محاسبة PCR Efficiency به دو روش رسم منحنی استاندارد و همچنین با استفاده از نرمافزارLinReg PCR انجام گرفت و در نهایت این دو روش آنالیز با هم مقایسه شدند. یافتهها: میزان کارآیی PCR محاسبه شده برای سه ژنGAPDH، TGF βو IL-10 با روش منحنی استاندارد بهترتیب 99/1، 81/1 و 87/1 و همچنین با روش استفاده از نرمافزار رایانهای LinReg PCR کارآیی این سه ژن بهترتیب 98/1، 82/1 و82/1 بهدست آمد. نتیجهگیری: نتایج این تحقیق نشان میدهد که در آنالیز دادههای حاصل از تکثیر cDNA میزان کارآییPCR بهدست آمده برای سه ژن GAPDH، TGF β و IL-10با دو روش مختلف منحنی استاندارد و LineRegPCR نتایج تقریباً یکسانی حاصل میشود. بنابراین، توصیه میشود که بهجای روش پرهزینه منحنی استاندارد از نرمافزار LinReg PCR استفاده گردد.
منابع مشابه
تشخیص میکرومتاستاز کارسینومای سلول کلیوی توسط مارکر CA9 با استفاده از روش Real-Time RT PCR
چکید ه سابقه و هدف حدود 40 درصد از مبتلایان به سرطان کلیه حتی پس از خارج نمودن کامل کلیه(رادیکال نفرکتومی) دچار متاستاز می‌شوند. بنابراین یافتن راهی برای تشخیص شروع متاستاز بسیار ارزشمند میباشد. در تحقیق حاضر، امکان تشخیص میکرومتاستاز سرطان کلیه با استفاده از نشانگر( (CA9 مورد بررسی قرار گرفته است. مواد و روش‌ها در یک مطالعه تجربی، از 30 بیمار مبتلا به سرطان کلیه که به بیمارستان دکتر...
متن کاملمقایسه حساسیت دو روش real-time pcr و rt-pcr برای تشخیص ویروس بیماری زای طیور
بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماری های ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. با توجه به اینکه روش های سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، هدف از انجام این مطالعه استفاده از تکنولوژی های نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور می باشد. استخراج rna از واکسن نیوکاسل سویه b1 و با استفاده از کیت rnease mini (شرکت کیاژن، آمریکا) و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام ش...
15 صفحه اولمقایسه روش Real-time PCR با استفاده از پرایمر همگانی 23s rRNA و روش کشت خون در تشخیص سپتی‌سمی
Background: Bloodstream infections (BSI) have a high incidence and high mortality in the worldwide. The mortality rate is variable between 20-70%. Therefore, early and timely detection of BSI agent in clinical laboratories is necessary. The aim of this study was to determine an efficient diagnostic tool to septicemia in accompany of blood culture method by Real-time PCR (using panbacterial 23S ...
متن کاملبررسی آدنوکارسینوم ریوی در گوسفندان مبتلا به بیماری های تنفسی مزمن با استفاده از روش Real-time PCR
آدنوکارسینوم ریوی گوسفند بیماری تنفسی مزمن با دوره‌ی کمون طولانی است که در اثر رتروویروس جاگزیکت ایجاد میشود. در پژوهش حاضر Real-time PCR به عنوان یک روش اختصاصی فوق‌العاده حساس برای شناسایی DNA پروویروسی این رتروویروس در نمونه‌های خون کامل گوسفندان به ظاهر سالم و مبتلا به بیماری‌های تنفسی مزمن در یک بررسی کشتارگاهی ارزیابی شد. هشتاد رأس گوسفند مبتلا به پنومونی مزمن و بیست رأس گوسفند سال...
متن کاملبررسی بیان ژن CYP1A1 در بیماران مبتلا به سرطان مری با استفاده از روش Real-time PCR
زمینه و هدف: سرطان مری توزیع و شیوع جغرافیایی بسیار متغیری نسبت به سایر انواع سرطان های شایع دارد. شیوع سرطان مری در ایران بسیار بالا می باشد. عوامل ژنتیکی مخصوصاً انکوژن‌ها از جمله عواملی است که در ایجاد و پیشرفت سرطان در بافت‌ها موثر هستند. در این میان ژن CYP1A1 (سیتوکروم P450، خانواده ١، زیر خانواده A، پلی پپتید ١) یکی از زیر خانواده های سیتوکروم P450 است که در سرطان مری نقش دارد، لذا هدف این...
متن کاملمطالعه الگوی بیان ژن های مرتبط با سرما در دو ژنوتیپ برنج با استفاده از روش real time pcr
اکثر رقم¬های برنج در برابر دماهای سرمازدگی، مخصوصا در مراحل اولیه¬ی رشد گیاهچه¬ای آسیب¬پذیر هستند. در این پژوهش الگوی بیان دو ژن واکنش دهنده به تنش سرمایی در دو رقم pr (رقم مقاوم) و هاشمی (رقم حساس) برنج (oryza sativa)با استفاده از تکنیک real time pcr مورد مطالعه قرار گرفت. پروفایل بیان دو ژن osnac6 و oscdpk13 در گیاهان شاهد و تیمارهای 3، 6، 9، 12و 24 ساعت سرما (5 درجه¬ی سانتی گراد) در گیاهچه¬ه...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 11 شماره 1
صفحات 85- 95
تاریخ انتشار 2012-03-20
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023